MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 plasmid pSL476_3

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011082	CCAT	2	8	8	15	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011082	ATCGCT	2	12	54	65	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011082	TCG	2	6	234	239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447303
4	NC_011082	CAG	2	6	305	310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447303
5	NC_011082	T	6	6	355	360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011082	AGA	2	6	432	437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011082	GAG	2	6	461	466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011082	GCG	2	6	517	522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447302
9	NC_011082	GTCT	2	8	524	531	0 %	50 %	25 %	25 %	194447302
10	NC_011082	GCAC	2	8	545	552	25 %	0 %	25 %	50 %	194447302
11	NC_011082	CGC	2	6	573	578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447302
12	NC_011082	TGC	2	6	582	587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447302
13	NC_011082	AAC	2	6	608	613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194447302
14	NC_011082	TGG	2	6	675	680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011082	GAT	2	6	749	754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447304
16	NC_011082	CTG	2	6	807	812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447304
17	NC_011082	GAA	2	6	861	866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447304
18	NC_011082	GAA	2	6	899	904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447304
19	NC_011082	CCG	2	6	945	950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194447304
20	NC_011082	TGA	2	6	967	972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447304
21	NC_011082	GGC	2	6	1051	1056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447304
22	NC_011082	TAC	2	6	1116	1121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447304
23	NC_011082	CG	3	6	1125	1130	0 %	0 %	50 %	50 %	194447304
24	NC_011082	ATC	2	6	1168	1173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194447304
25	NC_011082	GACG	2	8	1210	1217	25 %	0 %	50 %	25 %	194447304
26	NC_011082	AAT	2	6	1230	1235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194447304
27	NC_011082	AGG	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194447304
28	NC_011082	GGT	2	6	1358	1363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194447304
29	NC_011082	AGC	2	6	1377	1382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447304
30	NC_011082	G	7	7	1403	1409	0 %	0 %	100 %	0 %	194447304
31	NC_011082	GAA	2	6	1473	1478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447304
32	NC_011082	ACA	2	6	1603	1608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194447304
33	NC_011082	CAC	2	6	1638	1643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447304
34	NC_011082	CAC	2	6	1662	1667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194447304
35	NC_011082	GCA	2	6	1686	1691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447304
36	NC_011082	A	6	6	1693	1698	100 %	0 %	0 %	0 %	194447304
37	NC_011082	GGC	2	6	1762	1767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447304
38	NC_011082	AG	3	6	1837	1842	50 %	0 %	50 %	0 %	194447304
39	NC_011082	G	6	6	1880	1885	0 %	0 %	100 %	0 %	194447304
40	NC_011082	GCG	2	6	2064	2069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194447304
41	NC_011082	AGA	2	6	2105	2110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194447304
42	NC_011082	AAC	2	6	2131	2136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194447304
43	NC_011082	CGT	2	6	2154	2159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447304
44	NC_011082	CAG	2	6	2170	2175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447304
45	NC_011082	TTAT	2	8	2215	2222	25 %	75 %	0 %	0 %	194447304
46	NC_011082	AAC	2	6	2227	2232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194447304
47	NC_011082	CG	3	6	2283	2288	0 %	0 %	50 %	50 %	194447304
48	NC_011082	GCGA	2	8	2373	2380	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011082	T	7	7	2473	2479	0 %	100 %	0 %	0 %	194447305
50	NC_011082	TCG	2	6	2531	2536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194447305
51	NC_011082	CCT	2	6	2602	2607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194447305
52	NC_011082	TTCA	2	8	2651	2658	25 %	50 %	0 %	25 %	194447305
53	NC_011082	TTC	2	6	2679	2684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194447305
54	NC_011082	A	7	7	2722	2728	100 %	0 %	0 %	0 %	194447305
55	NC_011082	GAC	2	6	2786	2791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194447305
56	NC_011082	AG	3	6	2827	2832	50 %	0 %	50 %	0 %	194447305
57	NC_011082	TGA	2	6	2853	2858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194447305
58	NC_011082	GGC	2	6	2910	2915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011082	TGG	2	6	2929	2934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011082	GCG	2	6	2953	2958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011082	TTC	2	6	2986	2991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011082	TCCG	2	8	3024	3031	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011082	GTT	2	6	3079	3084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011082	A	12	12	3162	3173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011082	CGC	2	6	3209	3214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_011082	GT	3	6	3311	3316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.